柯南和小五郎等拉着大队，成本来到位于太平洋中的美丽小岛“神海岛”渡假。这座岛屿自古已有流传，成本大概有关沉没于海底的古代遗迹“海底宫殿”，及300年前两名女海盗遗留下来的宝藏传说。小兰和园子不惧流传，在“海底宫殿”附近潜水时，意外遇到一大群正在寻找宝物的猎人，不料其中一人突然遭鲨鱼攻击，不幸身亡！小兰和园子幸运逃难，柯南见那位猎人死状诡异，与灰原一起展开调查。柯南认为猎人之死，跟宝藏传说有着莫大关系，他试图解开背后原因，“海底宫殿”的谜题一直系绕在他的脑海中。他找到了一组神秘名词“Jolly Roger(海盗旗)”后，满以为有所起色，猎人却突然现身，并偷走了原来发现的宝藏！小兰和园子落在猎人的魔掌之中，性命危在旦夕！隐藏于传说中的讯息是什么？“海底宫殿”有什么秘密？穿越300年时光的暗号，柯南誓要逐步解开迷题
回复 :北岛玛雅（胜生真沙子 配音）是一个各方面看都很普通的少女，她家境贫穷，和母亲蜗居在店铺街的小二楼里。可是，一旦站到了舞台上，玛雅就会绽放出耀眼的光芒。无论什么样的剧本，只要看过一遍，就会牢牢记住其中的台词，拥有着这样能力的玛雅被当红明星月影千草（中西妙子 配音）相中了，玛雅加入了月影老师所在的月影剧团。初涉演艺界的玛雅获得了巨大的成功，同时也认识了另一剧团的樱小路优（三矢雄二 配音）。为了演出经典剧目《红天女》，一场明争暗斗在玛雅和同行姬川亚弓（松岛美野里 配音）之间展开。最终玛雅获得了演出资格，而她和速水真澄（野泽那智 配音）以及樱小路优之间的感情也在缓慢的发酵着。
回复 :梦想着将来成为了不起的画师的高中一年级学生冈仓天鼓林。实际上，却是一个没有干劲、没有才能，成天只会偷懒的废柴女高中生……在她面前突然出现了“风神雷神图屏风”中的雷神。「我来实现你的愿望——」如此说着的雷神召唤出了尾形光琳、高桥由一、狩野永德等等在日本美术史留下大名的大画家们。跨越时空，「让梦想成功的秘诀」不断传授给天鼓林。目标是素描甲子园的优胜！天鼓林能否成功改变自己，实现梦想呢？！
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